垂仁天皇の御代、勅令をもって火山鎮護の神、木花開耶姫命を祀ったのがはじまりとされる。桃山時代の代表的建造物の本殿、西宮本殿、武田信玄造営の東宮本殿は重要文化財に指定されている。